Innholdsfortegnelse:

Hvorfor er det nødvendig å rense PCR-produkter før sekvensering?
Hvorfor er det nødvendig å rense PCR-produkter før sekvensering?

Video: Hvorfor er det nødvendig å rense PCR-produkter før sekvensering?

Video: Hvorfor er det nødvendig å rense PCR-produkter før sekvensering?
Video: DNA Sequencing and PCR | Biology 2024, November
Anonim

Verifisering av ønsket produkt er viktig , som inkluderer bekreftelse av mangel på uspesifikke Produkter og primerdimere. Ren -opp av reaksjonsblandingen er også nødvendig for å fjerne ikke-inkorporerte primere og dNTP-er som kan forstyrre påfølgende reaksjoner og føre til en uleselig sekvens.

Dessuten, hvorfor er det nødvendig å rense PCR-produkter?

Du trenger å rense PCR-produkter å kvitte seg med ubrukte primere, nukleotider og enzymer for å optimere suksessen med ligering, som vil opprettholde og sekvensere produkt av PCR . Til rense de PCR-produkter , brukes størrelseseksklusjonskromatografi.

Man kan også spørre, bør man rense PCR-produkter før restriksjonsendonukleasefordøyelse? Flertallet av begrensning enzymer er aktive i PCR buffere. For kloningsapplikasjoner, rensing av PCR-produkter før fordøyelsen er nødvendig for å fjerne den aktive termofile DNA-polymerasen som er tilstede i PCR blanding. DNA-polymeraser kan endre endene av det spaltede DNA og redusere utbyttet av ligering.

Folk spør også, hvordan forbereder du PCR-produkter for sekvensering?

Direkte sekvensering av PCR-produkter

  1. Pass på at du har forsterket det riktige fragmentet.
  2. Du må fjerne alle gjenværende PCR-primere og ikke-inkorporerte nukleotider.
  3. Hvis PCR-primerne også vil være sekvenseringsprimeren(e), sørg for at de samsvarer med betingelsene våre.
  4. Ikke overkonsentrer prøven!

Kan du sekvensere PCR-produkt?

Direkte Sekvensering av PCR-produkter . Sekvensering bruker kun en primer i stedet for de to som brukes i PCR . Hvis du gjør ikke fjern begge primerne, du vil få to sekvenser lagt over hverandre som ikke er lesbare. Det er greit å bruke en PCR primer for sekvensering så lenge det samsvarer med våre betingelser.

Anbefalt: